Лидерство и магию обоих типов лучше не развивать свыше 4 лвл, дабы не случилось серьезного перекоса в балансе (ИМХО лидерство 4 лвла - это уже неслабый перекос).
Теперь следующее, обучение в такой башне сделать платным, скажем 20 золота и все деньги от обучения остаются в башне, тот кто ее разломает, сможет их извлечь из могилки, если башня погибает от старости то остается сундук с добром. Учится в башне сможет любой не враждебный герой.

Теперь несколько вариаций на эту же тему.
Можно всей этой системе придать легкий религиозный оттенок, но естественно с нотками политэизма. Назвать такие объекты не филосовскими башнями а храмами или капищами, но тогда нужно будет ввести в игру божеств по профессиональному или по территориальному признакам, например: Храм Бога-строителя, или Капище духа равнин и то и другое даст возможность герою развить навык ремесло до 5 лвл всего за 20 золотых.

В общем такая вот идея.

З.Ы. Просьба читателям хорошенько подумать, прежде чем кидать органику в афтара